Bioforense

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Calliphoridae y Mesembrinellidae (Diptera) de la Sierra Nevada de Santa Marta

Amat García, Eduardo Carlo | 2021-02-10

El conjunto de datos corresponde al registro de 3059 especímenes de moscas carroñeras de la familia Calliphoridae y Mesembrinellidae (Diptera, Oestroidea) cuyos números de catálogo asignados van desde el CETdeA-14639 hasta el CETdeA-17697 la recolección de los especímenes se llevo a cabo en 19 localidades de la Sierra Nevada de Santa Marta, del 2 al 6 de Marzo de 2013

Calliphoridae (Diptera) del Páramo de Belmira

Amat García, Eduardo Carlo | 2021-02-10

El paquete de datos corresponde al registro de 4114 especímenes de moscas carroñeras de la familia Calliphoridae (Diptera-Oestroidea) cuyos números de catálogo asignados van desde el CETdeA-10525 hasta el CETdeA-14638. La recolección de los especímenes consistió en 16 salidas de campo en 8 localidades del páramo de Belmira, ejecutadas desde el 13 de febrero de 2012 hasta el 18 de febrero de 2014.

Species identification of blow flies (Diptera, Calliphoridae) in the Northwest South America based on a DNA mini-barcode

Amat García, Eduardo Carlo | 2018-03-07

Molecular variability of Lucilia eximia in Colombia

Pérez Pérez, Juliana | 2015-06-10

Lucilia eximia is a species of fly in the family Calliphoridae (blowflies).

DNA barcoding of Lucilia eximia

Pérez Pérez, Juliana | 2016-02-16

Lucilia eximia is a species of fly in the family Calliphoridae (blowflies).

Protocolo para la limpieza y funcionamiento de la cámara de condiciones ambientales controladas

López Rubio, Andrés | 2018

Las condiciones ambientales influyen sobre el desarrollo del ciclo de vida de los insectos. En la entomología forense es muy importante determinar la duración del ciclo de vida y determinar curvas de crecimiento para cada especie, bajo diferentes escenarios climáticos, con el fin de aplicar esta información para los cálculos del IPM (Intervalo post mortem). Los escenarios climáticos en el laboratorio se pueden simular a través de una cámara de condiciones climáticas controladas (Fig. 1), equipo que permite controlar variables como temperatura, humedad y tiempos de iluminación (CCI, 2010; Panasonic, 2012)

Protocolo de preparación de muestras para envío a secuenciación (Caso Macrogen)

Cadavid Sánchez, Isabel Cristina | 2018

Los métodos de secuenciación han avanzado progresivamente desde 1975, año en el cual surgió el primero de ellos, el método de Sanger (Sanger, Nicklen & Coulson, 1977). Paralelamente, Maxam y Gilbert desarrollaron otro método que lleva su nombre, el método de Maxam- Gilbert. Desde entonces y hasta la actualidad, se han desarrollado otros tipos de métodos que permiten secuenciar a gran velocidad, lo cual ha sido de gran importancia para lograr la secuenciación completa de ADN de muchos genomas de animales, plantas y microorganismos. Estos métodos se conocen como técnicas de secuenciación masiva, más conocidas en inglés como next-generation sequencing (NGS).

Protocolo de lavado y esterilización de material en autoclave semiautomatizado

Pérez Pérez, Juliana | 2018

Cuando se procesan muestras de ácido desoxirribonucleico (ADN) es importante que todo el material utilizado sea estéril para evitar contaminación, no solo de microorganismos presentes en el ambiente, sino también de restos de ADN que pueden dar lugar a falsos positivos. Con la desinfección y esterilización se busca evitar contaminación de las muestras, aspecto esencial en la validez de los resultados obtenidos (Lauer, Battles & Vesley, 1982).

Preparación de solución de lisis para extracción de ADN descrito por Collins et al. (1987)

Cadavid Sánchez, Isabel Cristina | 2018

Para preparar el buffer de lisis descrito por Collins et al. (1987), utilizado en la extracción de ADN, es necesario emplear los reactivos que se describen a continuación, los cuales cumplen papeles fundamentales en la lisis de la célula para obtención de ADN. SDS (sodio dodecil sultafo), Sucrosa, NaCl (cloruro de sodio), Tris (hidroximetil amino metano), EDTA (Ácido etilendiaminotetraacético), HCl (ácido clorhídrico).

Montaje de alas de moscas para análisis morfométricos basados en puntos de referencia

Gómez García, Giovan Fernando | 2018

La morfometría geométrica surgió durante el siglo XIX, época en la que se dio un cambio en la cuantificación y análisis de los datos, con el propósito de obtener información de la geometría de estructuras (Rohlf & Marcus, 1993). A diferencia de la morfometría tradicional, que analiza variables como la longitud, el ancho, la altura o las relaciones entre medidas de estructuras (Adams, Rohlf & Slice, 2004; Rohlf & Bookstein, 1990), la morfometría geométrica analiza la forma (tamaño y conformación), lo cual se puede hacer por medio de estadística univariada y multivariada (Sarà, Favaloro & Mazzola, 1999)cultured in different conditions (lot A, monoculture tank; lot B, monoculture offshore cage; lot C, polyculture tank.

Manejo del estereomicroscopio

Pérez Hoyos, Adriana Marcela | 2018

La invención del estereomicroscopio se atribuye al diseñador estadounidense Horatio S. Greenough en el siglo XIX (Goeggel, 2007). También conocido como microscopio de disección, este es utilizado cotidianamente en entomología para lograr la visualización de caracteres morfológicos necesarios para la identificación taxonómica a nivel de familia, género o especie. En estos casos, la percepción de la profundidad y el contraste es crítica para la interpretación de la morfología de la estructura de interés del espécimen.

Gestión de información de colecciones de investigación biológica mediante el programa Specify 6: Importación de datos desde Excel

Ramírez Mora, Manuel Alejandro | 2018

Specify 6 permite la importación de datos sobre los especímenes desde hojas de cálculo de Microsoft Excel®. En esta sección se describe el paso a paso que permitirá realizar este procedimiento.

Fotografía de especímenes en el estereomicroscopio

López Rubio, Andrés | 2018

Extracción de ADN con DNeasy Blood & Tissue kit (QIAGEN), modificado para insectos

Pérez Pérez, Juliana | 2018

Electroforesis de ácido desoxirribonucleico (ADN) en gel de agarosa

Pérez Cardona, Alejandra | 2018

La electroforesis es una técnica de separación de moléculas, de acuerdo a su tamaño y reactividad (Westermeier et al., 2005), y puede ser utilizada en la separación del ADN. El ADN posee carga negativa debido a la presencia de grupos fosfato en su estructura, característica que permite que, bajo la influencia de un campo eléctrico aplicado, las moléculas migren en dirección al ánodo (carga positiva) (Westermeier, 1997). Para la electroforesis de ADN generalmente se emplea gel de agarosa como material de soporte. La agarosa es un polímero natural, polisacárido formado por galactosas alfa y beta que se extrae de las algas de los géneros Gellidium y Gracillaria.

El microscopio: fundamentos para su uso

Gómez García, Giovan Fernando | 2018-11-24

El microscopio fue inventado por el holandés Zaccharias Janssen en el siglo XVI. Años más tarde, en 1655, el inglés Robert Hooke creó el primer microscopio compuesto, que utilizaba dos sistemas de lentes: oculares y objetivos. Por su parte, el holandés Antoni Van Leeuwenhoek, un comerciante y científico neerlandés, fabricó sus propios microscopios monoculares de buen poder de resolución, que lo llevaron al descubrimiento de los glóbulos rojos en 1673, como también al descubrimiento de algunas bacterias y espermatozoides humanos. Por lo anterior, Leeuwenhoek es reconocido como la primera persona en interesarse en observar la naturaleza a través del microscopio (Wollman et al., 2015). Durante los siglos XVIII y XIX se realizaron avances para su mejoramiento, principalmente en Inglaterra. Durante la segunda mitad del siglo XIX, las empresas alemanas Leitz y Zeiss popularizaron el uso del microscopio de luz.

Disección, aclarado mediante el uso de ácido láctico y almacenamiento de genitales de moscas (Diptera: Calyptratae)

Pérez Hoyos, Adriana Marcela | 2018-11-24

En algunos grupos de insectos la morfología externa de los genitales, tanto de machos como hembras adultos, ha sido ampliamente utilizada como carácter válido para la determinación taxonómica de especies (Blahnik & Holzenthal, 2004). La alta diversidad de especies de moscas, así como su compleja morfología y taxonomía representan un constante reto para el avance de su conocimiento.

Amplificación de fragmentos de ADN mediante la reacción en cadena de la polimerasa clásica

Varela Pineda, Ana Milena | 2018

La Reacción en Cadena de la Polimerasa PCR (Polymerase Chain Reaction) descrita inicialmente por Kary Mullis en 1986, es una técnica que permite la amplificación de fragmentos específicos de ADN. Es un método basado en la síntesis de ácidos nucleicos in vitro mediante pequeños fragmentos de ADN o ARN llamados cebadores (primers, en inglés). Los cebadores son oligonucleótidos con alrededor de 17 a 30 pares de bases, que se hibridan a una secuencia complementaria de ADN y determinan el tamaño y la especificidad del fragmento que se va a amplificar (Ausubel et al., 2003)the first in the Current Protocols family of laboratory manuals, is the international standard by which all other laboratory manuals are judged. Originally published in 1987, CPMB now boasts of three looseleaf volumes (soon to expand to four volumes.

Primeros datos moleculares de algunas especies de interés forense del género Fannia Robineau-Desvoidy (Diptera) de Colombia

Londoño Martínez, Andrés Felipe | 2019

Potential distribution of mosquito vector species in a primary malaria endemic region of Colombia

Altamiranda Saavedra, Mariano Augusto | 2017

Rapid transformation of natural ecosystems changes ecological conditions for important human disease vector species; therefore, an essential task is to identify and understand the variables that shape distributions of these species to optimize efforts toward control and mit- igation. Ecological niche modeling was used to estimate the potential distribution and to assess hypotheses of niche similarity among the three main malaria vector species in north- ern Colombia: Anopheles nuneztovari, An. albimanus, and An. darlingi. Georeferenced point collection data and remotely sensed, fine-resolution satellite imagery were integrated across the Urabá –Bajo Cauca–Alto Sinú malaria endemic area using a maximum entropy algorithm. Results showed that An. nuneztovari has the widest geographic distribution, occupying almost the entire study region; this niche breadth is probably related to the ability of this species to colonize both, natural and disturbed environments. The model for An. dar- lingi showed that most suitable localities for this species in Bajo Cauca were along the Cauca and Nechı́ river. The riparian ecosystems in this region and the potential for rapid adaptation by this species to novel environments, may favor the establishment of popula- tions of this species. Apparently, the three main Colombian Anopheles vector species in this endemic area do not occupy environments either with high seasonality, or with low season- ality and high NDVI values. Estimated overlap in geographic space between An. nuneztovari and An. albimanus indicated broad spatial and environmental similarity between these spe- cies. An. nuneztovari has a broader niche and potential distribution. Dispersal ability of these species and their ability to occupy diverse environmental situations may facilitate sym- patry across many environmental and geographic contexts. These model results may be useful for the design and implementation of malaria species-specific vector control interven- tions optimized for this important malaria region.